Ольга, если Вы про регистрацию, то в консульстве (посольстве) им все равно, есть ли у Вас штамп о регистрации в общегражданском паспорте. В анкете на визу Вы просто указываете свой домашний адрес (Вы ведь не на улице живете) и телефон. Ваша регистрация внутри страны - это не проблема иностранных учреждений.

По законодательству РФ любой бомж ( я не про Вас, а про "классического" - живущего под мостом) имеет право получить загранпаспорт  и выехать.

Если у Вас на руках действующий загранпаспорт - обращайтесь за визой. Если Вам и откажут - то не по причине отсутствия регистрации в России, а по другим параметрам.